MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 1204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009726	TA	4	8	30	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009726	AT	3	6	61	66	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009726	GGGT	2	8	166	173	0 %	25 %	75 %	0 %	154688252
5	NC_009726	GGT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688252
6	NC_009726	AGA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
7	NC_009726	GAAC	2	8	412	419	50 %	0 %	25 %	25 %	154688252
8	NC_009726	CA	3	6	422	427	50 %	0 %	0 %	50 %	154688252
9	NC_009726	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	154688252
10	NC_009726	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
11	NC_009726	GTC	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363623
12	NC_009726	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
13	NC_009726	CCG	2	6	733	738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363623
14	NC_009726	GGTA	2	8	808	815	25 %	25 %	50 %	0 %	209363623
15	NC_009726	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
16	NC_009726	GCTG	2	8	889	896	0 %	25 %	50 %	25 %	209363623
17	NC_009726	CAT	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363623
18	NC_009726	CAATGG	2	12	937	948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209363623
19	NC_009726	TGA	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363623
20	NC_009726	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
21	NC_009726	AGA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363623
22	NC_009726	A	7	7	1051	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
23	NC_009726	CAGG	2	8	1219	1226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009726	TTC	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009726	GCC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009726	ATTG	2	8	1294	1301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009726	TGC	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009726	GCC	2	6	1369	1374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009726	T	6	6	1400	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009726	T	7	7	1469	1475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009726	TAT	2	6	1563	1568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009726	GAG	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009726	ATT	2	6	1599	1604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009726	A	6	6	1638	1643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009726	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009726	T	6	6	1716	1721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009726	TTCA	2	8	1726	1733	25 %	50 %	0 %	25 %	154688289
38	NC_009726	CTA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688289
39	NC_009726	AC	3	6	1756	1761	50 %	0 %	0 %	50 %	154688289
40	NC_009726	TGG	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688289
41	NC_009726	TGC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
42	NC_009726	ATCA	2	8	1822	1829	50 %	25 %	0 %	25 %	154688289
43	NC_009726	TC	3	6	1844	1849	0 %	50 %	0 %	50 %	154688289
44	NC_009726	CAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688289
45	NC_009726	TTA	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688289
46	NC_009726	AGCA	2	8	2056	2063	50 %	0 %	25 %	25 %	154688289
47	NC_009726	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	154688289
48	NC_009726	TGT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688289
49	NC_009726	T	6	6	2163	2168	0 %	100 %	0 %	0 %	154688289
50	NC_009726	TCG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
51	NC_009726	GGGGAA	2	12	2274	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688289
52	NC_009726	TG	3	6	2289	2294	0 %	50 %	50 %	0 %	154688289
53	NC_009726	TCG	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
54	NC_009726	GCCGCG	2	12	2460	2471	0 %	0 %	50 %	50 %	154688289
55	NC_009726	GGC	2	6	2620	2625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154688289
56	NC_009726	TAA	2	6	2833	2838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009726	A	6	6	2837	2842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009726	TTTA	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009726	AAAT	2	8	2908	2915	75 %	25 %	0 %	0 %	154688312
60	NC_009726	A	7	7	2943	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	154688312
61	NC_009726	ATG	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
62	NC_009726	TGA	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
63	NC_009726	GAAA	2	8	3459	3466	75 %	0 %	25 %	0 %	154688312
64	NC_009726	A	6	6	3468	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	154688312
65	NC_009726	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688312
66	NC_009726	AC	3	6	3532	3537	50 %	0 %	0 %	50 %	154688312
67	NC_009726	T	6	6	3544	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	154688312
68	NC_009726	GTG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688312
69	NC_009726	ATG	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
70	NC_009726	A	6	6	3686	3691	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
71	NC_009726	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
72	NC_009726	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
73	NC_009726	TTGC	2	8	3771	3778	0 %	50 %	25 %	25 %	154688308
74	NC_009726	A	7	7	3842	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
75	NC_009726	TGA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
76	NC_009726	A	6	6	3924	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
77	NC_009726	CTT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
78	NC_009726	ATGG	2	8	3990	3997	25 %	25 %	50 %	0 %	154688308
79	NC_009726	TCTT	2	8	4043	4050	0 %	75 %	0 %	25 %	154688308
80	NC_009726	TTG	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
81	NC_009726	GAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
82	NC_009726	CAT	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688308
83	NC_009726	TAA	2	6	4337	4342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
84	NC_009726	TTGA	2	8	4378	4385	25 %	50 %	25 %	0 %	154688308
85	NC_009726	TGA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
86	NC_009726	CTT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
87	NC_009726	GGA	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688308
88	NC_009726	GTT	3	9	4488	4496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
89	NC_009726	CTT	2	6	4616	4621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009726	CGAG	2	8	4683	4690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009726	TAG	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009726	AAT	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009726	ACC	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009726	ATTA	2	8	4786	4793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009726	TAATT	2	10	4842	4851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009726	CCAA	2	8	4852	4859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009726	GAA	2	6	4863	4868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009726	TTGC	2	8	4909	4916	0 %	50 %	25 %	25 %	154688260
99	NC_009726	CA	4	8	4936	4943	50 %	0 %	0 %	50 %	154688260
100	NC_009726	ATAC	2	8	4968	4975	50 %	25 %	0 %	25 %	154688260
101	NC_009726	TAT	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688260
102	NC_009726	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	154688260
103	NC_009726	TCT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688260
104	NC_009726	ATG	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688260
105	NC_009726	TGA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009726	AAT	2	6	5322	5327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009726	T	6	6	5332	5337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009726	TAAC	2	8	5434	5441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009726	CAA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009726	TGA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009726	GCA	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009726	T	6	6	5549	5554	0 %	100 %	0 %	0 %	209363624
113	NC_009726	GCAAT	2	10	5568	5577	40 %	20 %	20 %	20 %	209363624
114	NC_009726	CAA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
115	NC_009726	AGG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209363624
116	NC_009726	GAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
117	NC_009726	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
118	NC_009726	A	6	6	5972	5977	100 %	0 %	0 %	0 %	209363624
119	NC_009726	CAT	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
120	NC_009726	ATT	3	9	6009	6017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
121	NC_009726	AACGC	2	10	6029	6038	40 %	0 %	20 %	40 %	209363624
122	NC_009726	CTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363624
123	NC_009726	TGA	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
124	NC_009726	CG	3	6	6222	6227	0 %	0 %	50 %	50 %	209363624
125	NC_009726	GCA	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
126	NC_009726	AGA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
127	NC_009726	AGT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
128	NC_009726	CGCA	2	8	6478	6485	25 %	0 %	25 %	50 %	209363624
129	NC_009726	A	6	6	6569	6574	100 %	0 %	0 %	0 %	209363624
130	NC_009726	GC	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	209363624
131	NC_009726	AT	3	6	6740	6745	50 %	50 %	0 %	0 %	209363624
132	NC_009726	CA	3	6	6761	6766	50 %	0 %	0 %	50 %	209363624
133	NC_009726	CAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
134	NC_009726	ATT	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
135	NC_009726	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
136	NC_009726	AAC	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
137	NC_009726	GAA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
138	NC_009726	ATT	2	6	7066	7071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
139	NC_009726	CAAT	2	8	7114	7121	50 %	25 %	0 %	25 %	209363624
140	NC_009726	GTT	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
141	NC_009726	CAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
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262	NC_009726	A	6	6	11875	11880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009726	TC	3	6	11919	11924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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265	NC_009726	TAT	2	6	12109	12114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009726	TG	3	6	12164	12169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
267	NC_009726	TTAT	2	8	12184	12191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_009726	A	7	7	18557	18563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_009726	TGC	2	6	18564	18569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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411	NC_009726	TAA	2	6	18667	18672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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